harmonyos2-bindSC单细胞RNA测序、ATAC测序及空间转录组学数据双向整合分析
和声2 bindSC（B i次IN的tegration多组学d ATA选自S英格尔有丝测序技术）是R包单细胞的多组学整合分析，开发并在MDACC维持。bindSC的开发解决单细胞多组学数据集成的挑战，这些数据集成由未配对的细胞组成，具有跨模态的无与伦比的特征测量。除非匹配特征经验，否则以前的方法（例如、 ）在这种情况下不起作用。例如，scRNA-seq和scATAC-seq数据的整合需要通过计算基因体中的峰值来计算基因/启动子活性，这总是会丢失信息。该策略也不适用于整合scRNA-seq和cytof数据，因为由于scRNA-seq数据的稀疏性或翻译后修饰，基因压力和蛋白质丰度水平并不总是相关。bindSC包中实现的核心算法是BiCCA（Bi-order Canonical Correlation Analysis），它利用转换矩阵Z（L个样本的M个特征）将观察到的X（K个细胞的M个特征）与Y（N个特征）连接起来通过L细胞）。从先验知识初始化，通过同时最大化对(X, Z)的相关性和对(Y, Z)的相关性。
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