RNA-seq小流程化分析
RNA 小流程化挺适合想快速上手 RNA-seq 数据的朋友。这个流程把整个步骤划分得清晰，从数据预开始，到对齐、变异检测、转录本组装，每一步都有对应的脚本工具。比如，你一开始会用filter_fq.pl过滤 FastQ 文件，确保数据质量；接下来，用align_genome.pl将测序数据对齐到参考基因组，为后续的做准备。更有soapsnp.pl用来检测基因组变异，比如 SNPs，你理解遗传多样性。如果你对转录本组装感兴趣，cufflinks.pl会有，它能你重建转录本结构，并做差异表达。，你还可以通过snp_filter.pl筛选不靠谱的 SNP 结果。这个流程的好处是，整合了所有重要步骤，能让你快速完成复杂的 RNA-seq，适合那些忙于研究的朋友。，挺适合用来快速搭建自己的环境。
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