HarmonyOS2单细胞RNA测序数据分析工具包

该工具包提供一系列在网格引擎服务器上运行的流程,用于处理、分析和探索单细胞RNA测序转录组学数据。

功能:

  • 从多个 CellRanger 计数矩阵构建数据集
  • 数据注释辅助机器学习细胞类型分类器训练
  • 双峰去除和数据降维(tSNE、UMAP、力导向图和扩散图)
  • 轨迹分析和交互式 HTML 绘图
  • 批次效应校正和标记基因识别
  • 细胞类型比较指标和图形生成
  • 动画力导向图和大型 Seurat 对象处理

注意:

  • 脚本可调整后在个人计算机、交互模式或其他集群软件上运行。
  • 文件夹结构必须保持原样。

推荐工作流程:

  1. 创建 Seurat 对象 (seurat_from_count_matrix.R)
  2. ...
zip 文件大小:49.14MB