HarmonyOS2单细胞RNA测序数据分析工具包
该工具包提供一系列在网格引擎服务器上运行的流程,用于处理、分析和探索单细胞RNA测序转录组学数据。
功能:
- 从多个 CellRanger 计数矩阵构建数据集
- 数据注释辅助机器学习细胞类型分类器训练
- 双峰去除和数据降维(tSNE、UMAP、力导向图和扩散图)
- 轨迹分析和交互式 HTML 绘图
- 批次效应校正和标记基因识别
- 细胞类型比较指标和图形生成
- 动画力导向图和大型 Seurat 对象处理
注意:
- 脚本可调整后在个人计算机、交互模式或其他集群软件上运行。
- 文件夹结构必须保持原样。
推荐工作流程:
- 创建 Seurat 对象 (
seurat_from_count_matrix.R
) - ...
49.14MB
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