harmonyos2-FCA_liver用于解码人类胎肝造血的单细胞RNA-seq数据分析工具
harmonyos2-FCA_liver 是用于“解码人类胎肝造血”的所有软件的一个集成包。它基于Popescu、Botting、Stephenson等人于2019年提出的“解码胎儿肝脏造血”的研究方法，已去除了未使用的管道，这些管道仍可在其来源处找到。该数据集提供了一个门户网站，包含一系列管道，用于在网格引擎上运行的服务器上处理、分析以及探索性分析单细胞RNA测序转录组学数据。这些脚本也可用于个人计算机和/或交互模式，或者通过调整shell脚本，可以在其他集群软件上运行。该工具包支持解码人类胎肝造血过程中的血液与免疫系统发展，且由于其更广泛的适用性，已被用于扩展至其他项目。此捆绑包包括以下功能：
- 从多个CellRanger计数表构建数据集
- 数据注释、辅助训练机器学习细胞类型分类器
- 双峰去除
- 计算简化坐标（如tSNE、UMAP、力有向图、扩散图）
- 轨迹分析、交互式绘图（html页面形式）
- 批改正标志基因、细胞类型比较指标和图表创建
- 动画力有向图和大数据集Seurat对象处理
- 高级数据探索应用程序和Web门户的创建
若需要进一步了解，访问该存储库以获取详细信息。
文件大小：42.34MB
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