Python Bioinformatic生物信息学入门教程

Python 在生物信息学里的用法挺丰富的,尤其你有点编程基础的话,这本《Python Bioinformatic 生物信息学》算是个不错的入门资源。188 页不算太长,但内容蛮扎实,从 Python 基础讲起,一直延伸到Biopython怎么用。里面例子都是和生物学研究场景紧贴的,读着也不枯燥。

章节结构也清晰。前几章主要把 Python 常用的那些基础类型,比如字符串列表字典啥的过了一遍,适合从其他语言转过来的人看看对比。像Xrangerange的差别、Unicode,这种以前容易忽略的细节也讲了。

到后面开始上干货,了Biopython的一些模块用法,比如怎么解析 FASTA、怎么序列、怎么写脚本跑批量。搭配实际的生物学任务,一边学一边写,还挺能上手的。

适合那种:之前写过点PerlC,现在想快速转 Python 来搞生信的同学。哦,对了,它还有不少练习题,不只是看看理论那么简单。

如果你最近要写些和基因组、序列、结构预测相关的脚本,推荐你翻翻这本书,顺手还能练练Emacs用法,效率也能提不少。

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