Python for Bioinformatics第二版生物信息入门教材
生物信息的 Python 入门首选,Sebastian Bassi 的《Python for Bioinformatics》第二版,真的是蛮经典的一本教材。书里的例子都挺贴近实战,像是基因序列、数据解析、可视化啥的,全都有覆盖,而且讲得还比较通俗。用的库也不花哨,BioPython、matplotlib这些你肯定用过,代码跑起来也顺手。
章节安排比较合理,从基础讲到进阶,适合边读边练。像SeqIO
FASTQ 文件、matplotlib
画基因表达图,写起来也没多复杂。对刚入门的你来说,不会有太大门槛,对熟手来说,也能当工具书查着用。
我还翻了下其他一些相关资源,比如Sebastian Bassi 的 Python 教程,内容跟书是配套的,适合搭配来看。再比如Mastering Perl for Bioinformatics,如果你老项目还用 Perl,也可以参考参考。
嗯,总体来说,这本书比较适合喜欢用 Python 搞生信的朋友,既能练代码,又能长知识。如果你正在做基因组数据
或者转录组可视化
,可以试试从这本书里抄点思路。
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