pandas_plink 2.2.4遗传数据读取库

跨平台的pandas_plink-2.2.4轮子,专门为做遗传数据的朋友准备的,和 Pandas 搭配顺。它的底层是对 PLINK 文件格式的封装,像.bed.bim这些,直接读取成 DataFrame,方便得不行。你要是经常和 GWAS 数据打交道,这个库能省你一大堆预时间。

cp39manylinux2010_x86_64环境都适配得挺稳,不挑系统、不挑版本,装起来也没啥坑,直接pip install就行。性能上也不错,大数据量跑起来不拖后腿,响应也快。

用的时候注意下文件路径的问题,别忘了要提前确保文件存在,不然容易抛错。还有,如果你跟Pandasnumpyscikit-allel这些常用库一起用,效果更好。

如果你平时项目里用到遗传数据,或者需要和 PLINK 打交道,蛮推荐你试试这个库的,省事不少。

whl 文件大小:98.38KB