AFQ 1.2脑白质纤维定量分析

自动纤维定量用的 AFQ1.2,算是脑成像圈子里比较常用的一套工具了,搭配 vistasoft 用起来挺顺手。你只要配置好 SPMAFQ,基本一条命令就能跑起来,流程也清晰,不容易踩坑。

AFQ1.2 的主打是自动化脑白质纤维束的结构数据。你像 DTI 出来的数据,导进去之后,它会帮你自动完成预、纤维追踪、分段,输出一堆有用的定量指标,比如 FAMD,后面接统计或者可视化都方便。

vistasoft 是 AFQ1.2 的底层依赖,里面的工具函数蛮多,虽然有点 MATLAB 味,但结构清晰。推荐你从 afq_create 开始跑一下 demo,熟悉起来还挺快的。Git 地址在 这里

对了,跑 AFQ 要配 SPM,环境装好才能顺利开始。不然你会遇到路径报错或函数找不到的问题,是在 Mac 上,注意路径的写法。

如果你是做脑成像,尤其用 DTI 的,AFQ1.2 值得装一套。跑一遍自动流程,看看结果质量,也许会省掉不少手动的时间。

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用于自动纤维定量分析AFQ的软件包AFQ1.2 预估大小:294个文件
file
t1.nii.gz 18.61MB
file
tensors.nii.gz 10.63MB
file
t1.nii.gz 18.61MB
file
tensors.nii.gz 8.7MB
file
tensors.nii.gz 8.94MB
file
tensors.nii.gz 9.51MB
file
tensors.nii.gz 9.51MB
file
entries 2KB
file
all-wcprops 2KB
file
COPYING 676B
file
entries 503B
file
all-wcprops 272B
file
afq1.fig 8KB
file
.gitignore 22B
file
smoothpatch_inversedistance_double.c 7KB
file
vertex_neighbours_double.c 7KB
file
smoothpatch_curvature_double.c 7KB
file
patchnormals_double.c 5KB
file
vertex_neighbours_double.c 7KB
file
edge_tangents_double.c 7KB
zip 文件大小:204.13MB