AFQ 1.2脑白质纤维定量分析
自动纤维定量用的 AFQ1.2,算是脑成像圈子里比较常用的一套工具了,搭配 vistasoft
用起来挺顺手。你只要配置好 SPM
和 AFQ
,基本一条命令就能跑起来,流程也清晰,不容易踩坑。
AFQ1.2 的主打是自动化脑白质纤维束的结构数据。你像 DTI 出来的数据,导进去之后,它会帮你自动完成预、纤维追踪、分段,输出一堆有用的定量指标,比如 FA 和 MD,后面接统计或者可视化都方便。
vistasoft 是 AFQ1.2 的底层依赖,里面的工具函数蛮多,虽然有点 MATLAB 味,但结构清晰。推荐你从 afq_create
开始跑一下 demo,熟悉起来还挺快的。Git 地址在 这里。
对了,跑 AFQ 要配 SPM,环境装好才能顺利开始。不然你会遇到路径报错或函数找不到的问题,是在 Mac 上,注意路径的写法。
如果你是做脑成像,尤其用 DTI 的,AFQ1.2 值得装一套。跑一遍自动流程,看看结果质量,也许会省掉不少手动的时间。
用于自动纤维定量分析AFQ的软件包AFQ1.2
预估大小:294个文件
t1.nii.gz
18.61MB
tensors.nii.gz
10.63MB
t1.nii.gz
18.61MB
tensors.nii.gz
8.7MB
tensors.nii.gz
8.94MB
tensors.nii.gz
9.51MB
tensors.nii.gz
9.51MB
entries
2KB
all-wcprops
2KB
COPYING
676B
204.13MB
文件大小:
评论区